シナリオのポイント「未沙を基地に行かせる」「未沙を基地に行かせない」の選択肢あり。 基地内に敵を入れてはいけないので、基地周辺に機体を配置しておいたほうがよい。 敵2ターンに増援。 ある程度敵を減らすと敵の増援が登場。 敵6ターンに増援登場。そしてその後にダイターン3が登場。 マクロスが上昇するとシナリオクリアー。それまでに資金稼ぎをしておく必要がある。 クリアー後は3つのルートに分かれる。 リーンホースJr.:アムロ・クワトロ・ジュドー・カミーユ・ケーラ・スカル小隊・トップ部隊・SRXチーム・ライディーン関連・ グラン・ガラン:バニング・ウラキ・キース・モンシャ・ウッソ・シーブック・マサキ・リューネ・甲児・さやか・ボス・ガンダムW関連 ゴラオン:ダンバイン関連・ゲッターチーム・獣戦機隊・コンバトラーV・ボルテスチーム・万丈・大作・銀鈴さん・EVA
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